Sekä MIRNA:ta että SIRNA:ta kutsutaan ei-koodaaviksi RNA:iksi. Niillä on tärkeä rooli geenisäätelyssä. Niitä voidaan jopa käyttää parantamaan syöpää ja infektioita ainutlaatuisena lääkelääkeluokkana. Sekä MIRNA että SIRNA ovat lyhyitä, kaksisuuntaisia RNA-molekyylejä, jotka kohdistavat lähetti-RNA:han (mRNA) transkription jälkeisessä vaiheessa geenien hiljentämiseksi.
Mirna vs Sirna
Ero näiden kahden termin välillä. Mirna ja Sirna ovat, että SIRNA on eksogeeninen kaksijuosteinen RNA, jonka solut ottavat vastaan, kun taas MIRNA on yksijuosteinen ja johdettu endogeenisesta ei-koodaavasta RNA:sta. Lisäksi SIRNA:ta voidaan löytää alemmista eläimistä ja kasveista, mutta ei nisäkkäistä, kun taas miRNA:ita voi löytyä helposti kaikista eläimistä ja kasveista.
MikroRNA tunnetaan myös nimellä MIRNA on yksijuosteinen, pieni RNA-molekyyli, jossa on 19-25 nukleotidia. MIRNA luo kompleksin nimeltä miRISC, kun se sitoutuu RNA-indusoituun vaimennuskompleksiin (RISC) proteiiniin. Sitten, käyttämällä osittaista komplementaarista emäsparia, valitaan mRNA:t, joilla on komplementaariset sekvenssit antisense-RNA-säikeille miRISC-kompleksissa.
Pieni häiritsevä RNA tunnetaan myös nimellä SIRNA on suhteellisen lyhyt, kaksisuuntainen RNA, joka vaimentaa geenin ilmentymistä pilkkomalla lähetti-RNA:n (mRNA). Koska SIRNA voi kohdistaa vain yhden mRNA-molekyylin, se voi saada aikaan tarkan geeniekspression suppression. Lisäksi koska SIRNA:ta ei esiinny nisäkkäissä luonnollisesti, sitä voidaan käyttää kohdennetun lääkeaineena.
Vertailutaulukko Mirnan ja Sirnan välillä
| Vertailuparametrit | MIRNA | SIRNA |
| Esiintyminen | Sekä eläimillä että kasveilla on MIRNA. | Nisäkkään SIRNA puuttuu alemmista eläimistä ja kasveista. |
| Rakenne | MIRNA on yksijuosteinen molekyyli, joka on 18-25 nukleotidia pitkä. | SIRNA on dupleksimolekyyli, jossa on kaksi nukleotidia. |
| Dicer käsittely ennen | MIRNA on prekursorissaan MIRNA:ta ennen dicer-prosessointia, ja siinä on 70-100 nukleotidia hajallaan yhteensopimattomilla. Pre-MIRNA:n hiusneulasilmukkarakenne on olemassa. | SIRNA on kaksijuosteinen 30-100 nukleotidin RNA-molekyyli, joka on kaksijuosteinen ennen katkaisukäsittelyä. |
| Täydentävyys | MIRNA ja mRNA ovat osittain komplementaarisia. | SIRNA tai pieni häiritsevä RNA sopii täydellisesti kohde-mRNA:lle. |
| Geenisäätelymekanismit | MIRNA estää translaatiota aiheuttamalla mRNA:n hajoamista. | Endonukleolyyttinen pilkkominen säätelee geeniekspressiota SIRNA:n kautta. |
| Säätö | MIRNA säätelee samoja geenejä, joista MIRNA tuotetaan, samoin kuin monia muita. | SIRNA säätelee vain geenejä, joista SIRNA transkriptoidaan. |
| Kliiniset sovellukset | MIRNA:ta voidaan käyttää biomarkkerina, terapeuttisena kohteena, diagnostisena työkaluna tai farmakologisena kohteena. | Terapeuttisena aineena käytetään SIRNA:ta. |
Mikä on Mirna?
MIRNA on luonnollinen molekyyli, sitä ei voida luoda keinotekoisesti tai synteettisesti laboratoriossa tai käyttämällä kemiallisia yhdisteitä. Se on oletuksena luonnossa. Vuonna 1993 ensimmäinen MIRNA tai MicroRNA tunnistettiin C. Elegansissa. Pieni häiritsevä RNA (MIRNA) on eräänlainen RNA, joka vaimentaa geenin ilmentymistä transkription jälkeisessä vaiheessa.
RNA-polymeraasi suorittaa MIRNA-geenien transkription primäärisen MIRNA:n (pri-MIRNA) luomiseksi. Pri-MIRNA:n 5'-pää on peitetty, kun taas 3'-pää on polyadenyloitu, mikä muodostaa kaksijuosteisen varsi-silmukkarakenteen. Mikroprosessorikompleksi pilkkoo nämä pri-MIRNA-molekyylit ja tuottaa prekursorin MIRNA:ta (pre-MIRNA).
Pre-MIRNA-molekyyleissä on 70-100 nukleotidia dupleksimuodossaan. Aina kun kohteessa on korkea komplementaarisuus, endonukleolyyttinen pilkkoutuminen MIRNA:ssa on harvinaista. MIRNA:n transloimattomat alueet kohdistuvat ensisijaisesti. Exportin 5 siirtää pre-MIRNA-molekyylejä ytimestään sytoplasmaan, jossa Dicer-proteiinit prosessoivat ne MIRNA:ksi. Tämän seurauksena MIRNA on 18-25 nukleotidin RNA-dupleksi. Dicer-proteiinit ovat eräänlainen RNaasi III:n kaltainen entsyymi, jolla on tietty tehtävä.
Mikä on Sirna?
Sirna on luonnollinen ja synteettinen aine, joka voidaan valmistaa keinotekoisesti tai synteettisesti laboratoriossa tai kemiallisten komponenttien avulla. Sitä löytyy myös luonnosta. C. Elegansissa SIRNA tunnistettiin alun perin RNA-häiriönä (RNAi) tunnetussa mekanismissa, joka sisältää tehokkaan geenin suppression vieraalla RNA:lla.
Solun sisällä voidaan tuottaa kaksijuosteisia RNA-molekyylejä (dsRNA-molekyylejä) solugeenien transkriptiolla, patogeeni-infektiolla tai keinotekoisella lisäämisellä. Dicer-proteiinit pilkkovat tämän dsRNA:n pieniksi dsRNA:iksi, jotka tunnetaan nimellä SIRNA. Näillä siRNA:illa on kaksi nukleotidiylijännettä 3'-päässä ja ne ovat 21-23 nukleotidiä pitkiä. Sytoplasminen SIRNA on liitetty RISC-proteiineihin, ja RISC-endonukleaasi argonaute 2 (AGO2) katkaisee SIRNA-molekyylin sense-juosteen.
RNA:n tunkeutumista helpottaa MIRNA tai SIRNA, jotka ovat pienempiä RNA-molekyylejä. Samaa prosessia käyttävät molemmat pienemmät RNA-partikkelit säätelemään geenien ilmentymistä. Tutkijat käyttävät nyt keinotekoista SIRNA:ta, joka jäljittelee endogeenistä MIRNA:ta, hiljentämään tiettyjä syöpää aiheuttavia geenejä, vaikka onnistumisprosentti on edelleen liian alhainen. SIRNA:n antisense-RNA-juoste, joka on edelleen kytkettynä RISC-proteiiniin, tunnistaa sopivan mRNA-molekyylin. AGO2-komponentti on vastuussa kohde-mRNA-molekyylin pilkkomisesta.
Tärkeimmät erot Mirnan ja Sirnan välillä
- Mikroribonukleiinihappo (MIRNA) ja pieni häiritsevä ribonukleiinihappo (siRNA) ovat kahden tyyppisiä RNA-molekyylejä.
- SIRNA:lla on keskeisiä toimintoja geenien vaimentamisessa ja MIRNA:lla on ratkaiseva rooli geenisäätelyssä.
- Vaikka MIRNA on yksijuosteinen ribonukleiinihappomolekyyli, SIRNA on kaksijuosteinen ribonukleiinihappomolekyyli.
- Sekä MIRNA että SIRNA toimivat RNA-häiriöissä (RNAi), mutta yhdistettynä RNA:n indusoimaan vaimennuskompleksiin, SIRNA, joka on kaksijuosteinen, on parempi RNA:n pilkkomiseen (RISC).
- Vaikka MIRNA kiinnittyy kohteeseensa huonosti monissa paikoissa, SIRNA kiinnittyy kohteeseensa täydellisesti vain yhdessä paikassa.
Johtopäätös
dsRNA tunnetaan myös nimellä Keinotekoisesti syntetisoitu pienempi hiusneula, jota käytetään keinotekoiseen geenien hiljentämiseen nimeltä shRNA, ja RNAi:ta voidaan käyttää geeniterapiatutkimuksessa. Ekspressiovektoria käytetään kuljettamaan synteettisesti luotu dsRNA soluun, ja samaa menetelmää käytetään geenien hiljentämiseen. Proteiinin translaatio sisältää kolme erilaista RNA:ta.
Site RNA-tunkeutuminen on järjestyksestä riippuvainen mRNA:n deprivaatiomekanismi, joka säätelee geenin ilmentymistä. tRNA siirtää kodonin, mRNA välittää signaaleja proteiinin muodostukseen ja rRNA edistää paikan RNA:n häiriöitä. MiRISC-kompleksi voi estää translaatiota, hajottaa mRNA-molekyylin tai katkaista mRNA-molekyylin, kun se sitoutuu määrättyyn mRNA:han.
